許多蘑菇具有藥用價值。 例如，在古代我國，凍傷是用牛肝菌提取物治療的。 事實證明，相同的真菌能夠阻止惡性腫瘤的發展。 雨衣已被證明是一種出色的止血和防腐劑，可用於切割和出血。 落葉松海綿在哮喘發作期間緩解患者的病情，黃疸、雞油菌和某些類型的紅菇抑制葡萄球菌的繁殖。 蘑菇和香菇聲稱是一種天然抗生素，可以抵抗各種類型的呼吸道和腸道感染。 它們像平菇一樣，可以刺激免疫系統並改善脂質代謝。
某些類型的油含有一種可以緩解頭痛的物質。 此外，它們被推薦用於痛風發作，但異國情調的遠東香菇已成為一種出色的免疫調節劑。 這就是為什麼它不僅可以在超市（生的），也可以在藥房（以藥品的形式）購買。 在中國和日本，這些蘑菇因其提高效力的能力而受到重視（由於它們的鋅含量高）。 然而，患有痛風和尿石症的人不應該被蘑菇（尤其是香菇和牛肝菌）迷住，因為它們會加劇這些疾病。