使用 避孕套 有助於防止在肛交或陰道性交過程中傳播衣原體。 避孕套或 牙壩 也可作為口交時的保護手段。

當您有不安全的性行為或新的伴侶時，就會進行篩查。

必須對所有經過匿名和免費篩查中心（即使這些人來進行 HIV 篩查）、規劃中心、正畸中心的人進行系統的篩查。 在這些地方，10% 的篩查人員對衣原體呈陽性。 一些醫生建議對所有 25 歲以下的孕婦進行篩查。

定期篩查可以及時治療並防止感染傳播給新的伴侶。 如果結果呈陽性，請務必告訴任何可能接觸過您的人與您發生性關係。. 如果感染，她將需要立即接受檢測和治療。 這點極其重要，因為這種感染不免疫，連續感染幾次就可以了。 但是，在 84% 的情況下，新感染的人與第一次感染的人是同一個人！

通過簡單的測試，可以在男性和女性中檢測到衣原體。

第一次尿樣取自男性，取自女性，取第一次尿樣，或進行外陰陰道自採樣。

其他樣本是可能的，在尿道口、子宮頸（進行婦科檢查）以及直腸自我樣本或喉嚨中的樣本。