在幼兒中，如果荷爾蒙異常，治療可能包括注射 睾酮，其劑量和規律由內分泌學家設定。 這種遵循良好的治療會增加陰莖的大小。 當小陰莖由對睾酮不敏感的陰莖組織引起時，這種激素治療無效。

越早檢測到小陰莖，治療實施得越快，效果就越好。 青春期前後也可能需要治療。 青春期後，激素治療不再有效，因為組織不再以相同的方式反應。

小陰莖的手術治療     

在成年期，當小陰莖沒有得到治療或治療不夠有效時， 手術 是可能的。 然而，它並不總是呈現令人信服的結果。

韌帶部分 懸吊的 可以提供從陰莖到恥骨的陰莖。 它不會以任何方式改變陰莖，而是將其與恥骨部分分離，使其看起來更長。 觀察到的增益在鬆弛狀態下為 1 至 2 厘米，在勃起時為 1,7 厘米。 這種延長是以陰莖勃起不穩定為代價的，因為它與恥骨的連接不太好，這會使插入變得不那麼容易。

自體脂肪注射 包括將受試者的脂肪注射到陰莖皮下。 這不會以任何方式延長陰莖，但在視覺上使其更粗。 隨著時間的推移，只有一部分脂肪不會被身體吸收（10% 到 50%，具體取決於受試者）。 吸收可能不均勻並導致“玫瑰色”陰莖外觀。

小陰莖會產生顯著的心理影響，尤其是在青春期，重要的是要幫助該人並考慮他的疑慮。